F-index et connectivité entre populations de poissons
Le projet « F-index et connectivité entre populations de poissons » évalue l’impact de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’effacement des barrages de la Sélune. Il se base sur le calcul d’un indice de fragmentation génétique sur 5 espèces de poissons.
Le projet en bref…
| Titre complet | Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune |
| Objectifs | 1. Comprendre l’effet des barrages de la Sélune sur la différenciation génétique de 5 espèces de poissons. 2. Evaluer la vitesse et les conditions de restauration de la connectivité de ces 5 espèces après l’effacement des barrages. |
| Sujet(s) d’étude | Goujon, vairon, chevesne, chabot, loche franche |
| Méthodes utilisées | Pêche électrique, marqueurs microsatellites, F-index |
| Coordinateur(s) | Simon Blanchet et Guillaume Evanno |
| Laboratoires impliqués | Station d’Ecologie Théorique et Expérimentale (SETE) CNRS, Moulis UMR Dynamique et durabilité des écosystèmes de la source à l’océan (DECOD) INRAE/l’institut Agro/Ifremer, Rennes Unité Expérimentale d’Ecologie et d’Ecotoxicologie (U3E), INRAE, Rennes |
Contexte scientifique
La présence d’obstacles ou barrages dans les cours d’eau entraine une fragmentation des populations d’organismes aquatiques. Ce phénomène reste cependant difficilement quantifiable. En effet, un barrage peut ne pas empêcher totalement le passage de certaines espèces. De plus, l’effet de cette fragmentation sur la diversité génétique des espèces va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille de la population de l’espèce considérée.
Des scientifiques ont mis au point un indice de fragmentation, le F-index, afin de quantifier l’effet de la fragmentation d’un cours d’eau sur les populations d’organismes aquatiques. L’effacement des barrages de la Sélune constitue une occasion exceptionnelle de mesurer l’effet de fragmentation induit par les grands barrages sur plusieurs espèces de poissons, et de quantifier la diminution de cet effet suite à l’effacement des barrages.
Sujet(s) d’étude
Le projet se concentre sur 5 espèces de poissons présents dans la vallée de la Sélune : le goujon, le vairon, le chevesne, le chabot et la loche franche.
par Karelj, Domaine public
par Xocolatl 2012, Domaine public
par Viridiflavus CC-BY-SA 3.0
par Piet Spaans CC-BY-SA 2.5
par Adrien Pinot CC-BY-SA 3.0
Objectifs
Le projet de recherche a pour objectif de mesurer l’effet de la fragmentation sur 5 espèces de poissons dans la Sélune, en considérant deux phases :
- Avant l’effacement du dernier barrage – afin de comprendre l’effet des barrages sur la différenciation génétique des 5 espèces de poissons.
- Après l’effacement des barrages – afin d’évaluer la vitesse et les conditions de restauration de la connectivité entre les populations des 5 espèces considérées.
Méthodologie
Le projet de recherche se base sur la mesure d’un indice de fragmentation, le F index, développé par Prunier et al (2020). Cet indice permet de quantifier l’effet de fragmentation d’un barrage sur des populations d’organismes aquatiques, de manière standardisée, en tenant compte de l’âge des barrages et de la taille des populations considérées. Le F index est calculé pour 5 espèces de poissons présents dans la vallée de la Sélune (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche).
Pour cela:
- Des populations situées en aval et à l’amont sont échantillonnées par pêche électrique.
- Les échantillons de nageoire collectés sur chacune des 5 espèces sont génotypés au moyen de marqueurs microsatellites.
- Les campagnes d’échantillonnage sont réalisées 3 fois : avant, 1 ans puis 2 ans après l’effacement du dernier barrage.
Pour en savoir plus sur le développement et l’utilisation du F-index, n’hésitez pas à visionner cette vidéo présentée par Jerôme Prunier (CNRS). Durée 55 minutes.
Résultats et conclusions
Ce projet de recherche est en cours. Les résultats et conclusions seront élaborés ultérieurement.
Publications et rapports
Ce projet de recherche est en cours. Vous retrouverez ici la liste des rapport et publications.
Le projet « F-index et connectivité entre populations de poissons » fait partie de la seconde phase du programme scientifique Sélune. Retrouvez tous les projets de recherche sur cette page.