Zoom sur le SI - intégration des données IAS (saumons atlantique)

Zoom sur le SI - intégration des données d'abondances et captures de saumons atlantique (IAS)

Bancarisation, diffusion et visualisation des données et métadonnées : Abondances et captures de saumons atlantique (IAS)

De quelles données s'agit-il ?

Cet article traite spécifiquement de l'intégration dans le système d'informations SI Sélune des données associées aux suivis réalisés sur les juvéniles de saumons atlantiques dans le cadre du suivi d'abondance IAS (Indice D'Abondance Saumon). 

Dans le cadre de l'Observatoire Sélune, les campagnes annuelles de terrain respectent le protocole de pêche mis au point par l’INRAE et l'OFB. L’objectif de cette méthode est d’estimer le niveau d’abondance de juvéniles de saumon atlantique Salmo salar sur une station. Le protocole permet de recenser les juvéniles de l’année (d’âge 0+) dont l’abondance traduit le renouvellement des générations au sein de la population et la survie après éclosion des oeufs dans les zones de reproductions hivernales. Les campagnes de terrain sont assurées par INRAe et les Fédérations  départementales de la Manche et d'Ille-et-Vilaine pour la Pêche et la Protection du Milieu Aquatique (FDAAPPMA50 et FDAAPPMA35).

Les données mises à disposition dans SISélune respectent INSPIRE et s'appuient sur les principes F.A.I.R. Data.

Les métadonnées concernées

Trois fiches de métadonnées accompagnent les données d'abondances et de captures des saumons atlantique de l'observatoire Sélune. Ces fiches décrivent les données proposées, les modalités d'acquisition, leur temporalité et leur spatialisation.

pictogramme représentant un saumon atlantique

 

Consulter / Télécharger les données

1. Via les métadonnées

Chacune des fiches de métadonnées permet d'accéder, via des liens de téléchargement, aux données au format CSV et shapefile (SHP). 

2. Via le portail cartographique

Le portail cartographique, accessible via l'url : https://geosas.fr/selune/#, présente ces jeux de données dans le thème "Observatoire Sélune" et le sous-thème "Saumons atlantiques".

Elle permet de visualiser les secteurs de pêches scientifiques à électricité échantillonnés dans le cadre du protocole IAS .

Il est possible de changer cette campagne en cliquant sur le pictogramme "V" situé sous la légende de la couche. Cela laisse apparaître une liste déroulante "Choix de la campagne" permettant de sélectionner l'année souhaitée.

Elle permet de visualiser les données d'abondances par classe d'âge et par secteur de pêches scientifiques. Elle permet également de visualiser les données biométriques associées aux captures effectuées.

Il est possible de changer cette campagne en cliquant sur le pictogramme "V" situé sous la légende de la couche. Cela laisse apparaître une liste déroulante "Choix de la campagne" permettant de sélectionner l’année souhaitée. 

Il est également possible de changer le mode de visualisation de ces données : Absence / Présence (par défaut) ou en classes d'abondance en cliquant sur le pictogramme "V" situé sous la légende de la couche. Cela laisse apparaître une liste déroulante "Analyse" permettant de sélectionner le mode d’affichage souhaité.

NB : Plusieurs alternatives de visualisation existent pour l'absence / présence proposant des couleurs différentes (cela permet d'afficher sur la même carte des absences / présences de saumons et autres espèces (truites, anguilles, ...).

Une fois la campagne sélectionnée, il est possible de consulter des informations supplémentaires et spécifiques à chaque station pour la campagne sélectionnée.

il est donc possible de consulter des données supplémentaires et spécifiques à chaque station pour la campagne sélectionnée : 

  • La valeur de l'indice IAS pour le secteur et la campagne sélectionnée,
  • Les données contextuelles de la pêche réalisée (durée, nombre de traits, opérateur) pour le secteur et la campagne sélectionnée,
  • Les données biométriques (longueur à la fourche et poids) de l'ensemble des captures de saumons atlantiques réalisées pour le secteur et la campagne sélectionnées.

La campagne sélectionnée permet également :

  • D'accéder à une page du site web fournissant des explications relatives à ce suivi scientifique de l'observatoire,
  • D'accéder directement aux fiches de métadonnées associées à ces jeux de données,
  • De télécharger les données au format CSV et JSON.

Exemple de carte IAS sur le portail cartographique :

3. via le serveur cartographique

Les urls d'accès permettant d'obtenir les couches de donnée du SI Sélune sont les suivantes :

Les couches permettant de récupérer les données IAS : 

  • Secteurs d'étude des saumons atlantiques (IAS) par session - Observatoire Sélune : v_bioc_ias_sctr_ias_sessions
  • Abondances en saumons atlantiques (IAS) - Observatoire Sélune : v_bioc_ias_ab_ias
  • Captures de saumons atlantiques (IAS) - Observatoire Sélune : v_bioc_ias_ind_ias